Bidhaa

Topolojia ya utando wa kikoa cha kituo cha colicin E1 ilichunguzwa na uhamishaji wa nishati ya resonance ya fluorescence (FRET).FRET ilihusisha asidi ya amino iliyosimbwa kwa vinasaba (coumarin) kama mtoaji na mabaki ya cysteine ​​yaliyowekwa alama kwa kutumia DABMI (4-(dimethylamino)phenylazophenyl-4'-maleimide) kama kipokeaji cha FRET.Mabaki ya coumarin ya umeme yalijumuishwa kwenye protini kupitia jozi ya sinteta ya tRNA/aminoacyl-tRNA ya orthogonal ambayo iliruhusu kujumuishwa kwa kuchagua kwenye tovuti yoyote ndani ya kikoa cha kituo cha colicin.Kila lahaja lilikuwa na mabadiliko ya kusimama (TAG) kwa kujumuishwa kwa coumarin na mabadiliko ya cysteine ​​(TGT) kwa kiambatisho cha DABMI.Umbali sita kati ya helikopta 1-6 ulibainishwa kwa kutumia uchanganuzi wa FRET kwa hali mumunyifu na utando.Data ya FRET ilionyesha mabadiliko makubwa katika umbali baina ya helikopta 3-6 kwenye muungano wa utando unaotoa maarifa mapya kuhusu muundo wa utando wa kikoa cha kituo.Kwa ujumla, ufanisi wa kiuanzilishi wa coumarin-DABMI FRET ulipungua kwa kuunganishwa kwa membrane, ikijengwa juu ya muundo wa mwavuli wa chaneli ya colicin.Muundo wa majaribio wa hali iliyofungwa ya kikoa cha kituo uliundwa kulingana na data ya sasa na iliyochapishwa hapo awali ya FRET.Muundo unapendekeza mpangilio wa duara wa heli 1-7 kwa mwelekeo wa saa kutoka upande wa nje ya seli na muungano wa uso wa utando wa heli 1, 6, 7, na 10 karibu na pini ya kati ya transmembrane iliyoundwa na helis 8 na 9.